La Fundació Salut Empordà aposta per una estructura de treball participativa amb la creació de comissions i equips de treball interdisciplinaris, que comparteixen objectius comuns i plantegen estratègies de millora contínua de la qualitat assistencial.
Les comissions de qualitat estan formades per grups interdisciplinaris amb professionals experts, principalment assistencials. Assessoren la direcció assistencial en l'estudi i la millora d'àrees o aspectes clau de l'atenció sanitària i de la qualitat assistencial.
El 21,30 % de les persones treballadores assistencials participen en comissions de qualitat.